在朝堂上，福王朱由崧收到史可法请“去监国之号，臣服明帝”的奏章，脸黑得像黑炭，三十七岁的朱由崧，小字福八，却一点福也没有，这一辈子历尽坎坷，李自成陷洛阳，他的父亲朱常洵缒城出，藏匿于迎恩寺，后被搜出遇害。朱由崧自己缒城逃脱，前往怀庆避难，崇祯十七年怀庆闻警，朱由崧又逃亡卫辉，投奔潞王朱常淓，三月卫辉闻警，朱由崧又随潞王逃往淮安，一直躲在船里，三月十八日才上岸，好不容易斗智斗勇，当了监国，吴三桂又携带太子朱慈烺返京城登基称明帝，他不甘心这么认命，不甘心让位，他望了一眼东阁大学士、兵部尚书马士英，道：“听说当时李自成的贼军围城跟铁桶一样，连一只苍蝇都飞不出去，这京城的太子不会有假吧？”
马士英还没吭声，史可法道：“臣让教过太子读书的老师方拱乾、杨士聪，还有司礼监太监马朝进和东宫伴读丘志忠等人到京城辨认，已确认吴三桂拥立的太子为真。”
福王朱由崧很忐忑，道：“听说那平西伯吴三桂勾结满清，我侄儿不会入了董贼那样的豺狼之手吗？”
史可法知道福王朱由崧说的董贼就是三国时的董卓，他不认同把吴三桂比作董卓，反驳道：“先帝以圣明之主，遘变非常，即枭逆闯之头，不足纾宗社臣民之恨，是目前最急者无逾于办寇矣。平西伯因其顺势，先国仇之大，而特宥前辜，借兵力之强，而尽歼其丑类，亦今日不得不然之著数，乃当世之豪杰也！”
这时，以钱谦益为首的东林党人也力请福王“去监国之号，臣服明帝”，钱谦益于是向福王朱由崧报告了一个重大的军情：“宁南伯左良玉已经率军二十万顺江东下，支持太子朱慈烺。”
因为左良玉的做官曾得力于侯恂的推荐，侯恂本是东林党人，左良玉是站在东林党人的一边。
另外，李自成在居庸关战败，左良玉利用这个时机收复了湖北西部的荆州、德安、承天，这时左良玉拥有八十万兵力，号称百万，前五营是他的亲兵，后五营是投降过来的士兵。湖广巡抚何腾蛟以及总督袁继咸住在江西，他们都跟左良玉很友好，这一带都宣布效忠明帝朱慈烺。
更重要的是，太子朱慈烺即位后，吴应熊未雨绸缪，让明帝加封左良玉为平南王。
史可法又说，明帝已经派使者到南京，加封黄得功、高杰、刘泽清、刘良佐为四镇军官为伯，他们的子孙世袭官职。
马士英一听，内心的防线彻底奔溃了，自己那五万兵，就算齐心协力，也打不过左良玉，更何况明帝还分化了他的手下，再怎么挣扎也没用了，于是原本一言不发的他，也开始劝福王朱由崧认命，否则自己也保不了他的小命。
朱由崧众叛亲离，欲哭无泪，没有办法，只好宣布取消监国的称号，做回自己的福王，南明朝廷自行解散。
最终，史可法带领在南京的六部大臣北上辅政，南明归心，大明朝的政权重新初定。
新皇朱慈烺决定成立新禁军，从左良玉、马士英、吴三桂、唐通、白广恩、姜襄等各军营中抽精兵三千，一共六万人，交给吴应熊、何承志、满云龙三兄弟训练，拱卫京师。
